卵巢巧克力囊肿复发且伴有小肚子疼痛、闭经，可能由多种因素导致，如激素失衡、囊肿增大、炎症反应、粘连形成、心理压力等。 1.激素失衡：体内激素水平的变化可能影响月经和导致囊肿复发。可通过激素六项检查明确，必要时使用激素调节药物，如地屈孕酮、戊酸雌二醇等。 2.囊肿增大：复发的囊肿体积增大，压迫周围组织，引起疼痛。需进行超声检查评估，可能需再次手术或介入治疗。 3.炎症反应：盆腔炎症可能加重症状。通过血常规等检查判断，使用抗生素如头孢呋辛酯、甲硝唑等治疗。 4.粘连形成：手术部位粘连影响器官功能。通过腹腔镜检查确认，必要时进行粘连松解术。 5.心理压力：长期精神紧张可能影响内分泌。要注意心理调节，保持良好心态。 总之，出现这种情况应及时到正规医院妇科就诊，进行全面检查，明确原因，采取针对性治疗措施。同时，要注意休息，避免劳累和剧烈运动。

巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢引起的．子宫肌瘤可能和内分泌有关．治疗有保守和手术两种方法，保守疗法一般是考虑中医中药的方法的。

卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，可引起进行性痛经和不孕。你的卵巢巧克力囊肿比较大，药物治疗效果不佳，有手术指征，建议行腹腔镜下卵巢囊肿剔除术，若病理检查确诊是巧克力囊肿，术后还须服用孕三烯酮半年预防复发。

一般3个厘米内的考虑用药。3个厘米以上的根据患者体质，囊肿的位置大小血流信号，综合考虑。