睡觉时翻身肚子疼醒，晨起腰两侧酸疼，可能是肌肉拉伤、着凉、泌尿系统问题、腰椎疾病、妇科或男科疾病等原因引起。 1. 肌肉拉伤：翻身时动作幅度过大，可能导致腹部和腰部肌肉拉伤。肌肉拉伤后会出现疼痛，活动时加重。治疗主要是休息、热敷、按摩等。 2. 着凉：夜间睡眠时保暖不当，腹部和腰部着凉，可引起肌肉痉挛性疼痛。注意保暖，多喝温水，一般可缓解。 3. 泌尿系统问题：如肾结石、输尿管结石等，可能引起腹部和腰部疼痛。需要进行泌尿系统超声等检查明确，较小的结石可通过多喝水、多运动排出，较大的结石可能需要碎石或手术治疗。 4. 腰椎疾病：腰椎间盘突出、腰椎骨质增生等，压迫神经时可出现腰部及腹部放射性疼痛。治疗包括卧床休息、物理治疗、药物治疗（如布洛芬、双氯芬酸钠、甲钴胺等），严重时可能需要手术。 5. 妇科或男科疾病：女性的盆腔炎、附件炎，男性的前列腺炎等，也可能出现类似症状。需要进行相关检查，如妇科超声、前列腺液检查等，明确后进行抗炎治疗（如左氧氟沙星、头孢呋辛等）。 出现这种情况，如果休息后不能缓解或疼痛加重，应及时到正规医院就诊，查明原因，进行针对性治疗。