怀孕三个月时肚子疼痛似痛经，可能是正常的生理变化，也可能与先兆流产、宫外孕、子宫肌瘤、胃肠道问题、泌尿系统感染等有关。自行处理身体不适可能加重病情，及时就医并遵循医生的治疗方案是关键。
1.正常生理变化：怀孕后子宫增大，子宫圆韧带被牵拉，很多孕妇会感觉肚子隐隐作痛。这种疼痛通常较轻微，休息后可缓解。
2.先兆流产：多由于胚胎染色体异常、孕妇内分泌失调、免疫功能异常等。表现为阴道少量流血，常为暗红色或血性白带，随后出现阵发性下腹痛或腰背痛。
3.宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床。常伴有停经、腹痛、阴道流血等症状，腹痛多为一侧下腹部隐痛或酸胀感。
4.子宫肌瘤：如果孕妇本身患有子宫肌瘤，随着孕期子宫增大，肌瘤可能发生红色变性，引起腹痛。
5.胃肠道问题：如消化不良、肠胃炎等，可能导致腹部疼痛，还可能伴有恶心、呕吐、腹泻等症状。
6.泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎，除了腹痛，还会有尿频、尿急、尿痛等表现。
总之，怀孕三个月出现肚子疼痛似痛经的情况，原因较为复杂。孕妇应注意休息，避免劳累和剧烈运动。如果腹痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时到正规医院妇产科就诊，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。