对儿童自闭症要采用综合性的治疗方法。治疗上最重要的是教育和行为治疗，目的是促进对患儿正常行为的教育，特别是社会性行为的矫正，纠正异常行为，消除睡眠障碍、发脾气、多动等继发性症状等。药物治疗仅对个别症状可能有效，且要在医师的指导下服用。如短期严重失眠，可用安定;有攻击行为，可用奋乃静;促进脑功能的药物可选用脑复新、脑复康，或Y-酪氨酸，此外，利他林对治疗孤独和语言障碍有效。近年来，有人报告，服用芬氟拉明治疗自闭症获得疗效，服用后可减轻多动及刻板动作，改善注意力，对有些病例尚可提高智商。

心理治疗只是缓解一时的症状，待时间一长，病情还是会反弹，需要长期治疗，且见效慢。目前，我国心理治疗自闭症收费比较高，一般的家庭尚不能负担得起。

有充分证据显示，自闭症学生与家庭背景和父母教养的态度无关，亦不是因后天环境造成， 自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致，自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致