男性生殖器官根部出现疼痛的疙瘩，可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿、生殖器疱疹、尖锐湿疣、淋巴结肿大等原因造成的。 1.毛囊炎：毛囊受到细菌感染，引发炎症，出现红肿疼痛的疙瘩。可局部涂抹莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等。 2.皮脂腺囊肿：皮脂腺排泄管阻塞，皮脂逐渐淤积形成囊肿。若有感染，会疼痛，可口服头孢呋辛酯片、阿莫西林胶囊等。 3.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，会有簇集性水疱，伴有疼痛。可使用阿昔洛韦乳膏、伐昔洛韦片等。 4.尖锐湿疣：人乳头瘤病毒感染所致，初期为细小淡红色丘疹，逐渐增大。一般采用激光、冷冻等治疗方法。 5.淋巴结肿大：附近组织炎症或其他疾病导致淋巴结反应性增大。需针对原发病治疗，如使用抗生素等。 当男性生殖器官根部出现疼痛的疙瘩时，不要自行处理，应尽快前往正规医院的泌尿外科或皮肤科就诊，明确病因后进行针对性治疗。

不要自己乱用药单从症状不好判断的建议去医院检查确诊的