6岁小孩患病毒性心肌炎后头痛，可能与以下因素有关：病毒感染未愈、休息不足、精神紧张、药物副作用、合并其他疾病。健康无小事，身体不适切莫忽视。及时就医，根据医生指导进行治疗，早日恢复健康。
1.病毒感染未愈：病毒可能仍在体内活动，影响神经系统，导致头痛。
2.休息不足：患病后身体虚弱，若休息不好，易引发头痛。
3.精神紧张：孩子对病情担忧，精神压力大，可能出现头痛。
4.药物副作用：治疗心肌炎的某些药物可能产生头痛的不良反应。
5.合并其他疾病：如感冒、鼻窦炎等，也会有头痛症状。
孩子出现头痛应及时就医，明确原因，采取相应措施。

心肌炎的治疗,急性期建议静点极化液等一到两周,卧床休息1-3个月,口服药物3个月到半年,限制运动一年左右.药物可以应用荣心丸,辅酶Q10,果糖,维生素C等.心肌炎的治疗要有信心绝大部分心肌炎患者都可以痊愈,部分会遗留后遗症,只有很少的患者发展为慢性或者扩张型心肌病.限制运动量主要是最开始要绝对限制,以卧床休息为主,心肌酶恢复正常后仍需要限制运动,不能从事剧烈运动,增加心脏的负荷

病毒性心肌炎属于感染性心肌疾病，一般都是由病毒感染引起的心肌局限性或弥漫性的急性或慢性炎症病变。患者要积极进行抗感染的治疗，同时，注意多休息，饮食方面进易消化和富含蛋白质的食物。

后脑疼，需要做一些检查，头部ct扫描看看情况如何，还有要看看耳鼻喉科医师是否有鼻窦炎情况。这些原因都会导致后脑部位疼痛。

头痛的原因比较复杂，建议到医院检查治疗。不要延误耽搁病情。