12个月女宝未长牙且指甲扁，可能是营养缺乏、遗传、疾病、发育差异、环境因素等所致。当身体出现异常时，应赶紧就医，听从医生的指导进行诊治，不宜擅自用药。
1.营养缺乏：钙、维生素D等摄入不足，影响牙齿和指甲发育。
2.遗传：家族中有出牙晚或指甲异常的情况。
3.疾病：甲状腺功能减退等疾病可能导致。
4.发育差异：个体发育节奏不同，部分孩子出牙较晚。
5.环境因素：生活环境不良，影响孩子生长发育。
孩子出现这种情况，家长不必过于焦虑。可先带孩子就医检查，明确原因，针对性改善。

你说的情况有可能存在微量元素的缺失，头部还有2厘米软软的是前囟门吗？但是需要化验明确才可以知道到底缺什么，缺的话缺什么补什么，不要盲目的添加，只要辅食合适没有必要额外添加的！

孩子十二个月，不长牙齿，前囟未闭，应考虑缺乏维生素D。建议给孩子补充维生素D，在此基础上补充钙剂。

很可能是缺钙引起的，估计也有缺铁性贫血建议去医院化验微量元素、血常规，可以初步判断病因，如果缺乏某些微量元素，应该进行针对性补充，及时添加辅食，保证婴幼儿生长发育需要。

从你的描述来看，你孩子的情况是因为缺钙，缺铁造成的出牙迟，同时合并有指甲不好的情况的。你可以先给孩子补充钙剂，我建议应用龙母壮骨颗粒，小儿鱼肝油进行治疗，这样就可以改善孩子出牙迟和前囟门不闭合的情况的，在补充钙剂后，在补充铁剂，服用健脾生血颗粒，这样就可以对孩子指甲扁的情况有很好的治疗的。