小孩子指甲凹凸不平可能由多种因素导致，包括营养不良、微量元素缺乏、真菌感染、甲床损伤、疾病影响等。当身体出现异常时，应赶紧就医，听从医生的指导进行诊治，不宜擅自用药。
1.营养不良：孩子饮食不均衡，蛋白质、维生素等摄入不足，影响指甲生长。要保证孩子摄入足够的蛋类、肉类、新鲜蔬果等。
2.微量元素缺乏：如缺钙、铁、锌等，可通过饮食补充，也可在医生指导下服用葡萄糖酸钙口服液、硫酸亚铁片、葡萄糖酸锌口服液等。
3.真菌感染：常见的有灰指甲，具有传染性。需使用抗真菌药物，如特比萘芬乳膏、酮康唑乳膏等，必要时口服伊曲康唑胶囊。
4.甲床损伤：外伤或长期挤压指甲，使甲床受损。应避免损伤，注意指甲保护。
5.疾病影响：某些全身性疾病如银屑病、扁平苔藓等也可能引起。需积极治疗原发疾病。
总之，当发现孩子指甲凹凸不平时，家长应重视，及时调整孩子饮食，注意指甲护理。若情况持续不改善或加重，应带孩子到正规医院皮肤科就诊，查明原因，对症治疗。

小孩子指甲凹凸不平因饮食不够缺乏营养，缺乏微量元素或者维生素等原因，还有不注意个人卫生而引发病菌的感染也会导致指甲出现凹凸不平的情况，如果指甲的症状除了凹陷，凹凸不平之外，还带有变黄，增厚的情况那么就一定是灰指甲，这就需要及时前往医院检查并接受治疗。