月经走后第五天同房后肚子阵痛，可能是由生理性原因，如排卵痛，也可能是病理性原因，如盆腔炎、子宫内膜异位症、肠痉挛、宫颈炎等。 1. 排卵痛：女性在排卵时，卵泡破裂以及排卵后卵泡液对腹膜的刺激，可能会引起轻微的腹痛，一般疼痛较轻微，持续时间短。 2. 盆腔炎：盆腔发生炎症时，炎症刺激会导致下腹疼痛，还可能伴有发热、阴道分泌物增多等症状。 3. 子宫内膜异位症：子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位，在月经周期时会出现疼痛，疼痛多为进行性加重。 4. 肠痉挛：腹部着凉、饮食不当等可能引起肠道平滑肌强烈收缩，导致肠痉挛，出现阵发性腹痛。 5. 宫颈炎：宫颈发生炎症时，性生活可能会刺激宫颈，引起下腹疼痛，常伴有白带异常。 如果腹痛持续不缓解或伴有其他不适，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，明确病因后采取相应的治疗措施。

您的情况月经干净，第5天性生活的话，一般来说属于安全期同房是不会怀孕的，您这个月2号3号出现肚子一阵阵的疼痛，有可能是排卵期的原因导致的，建议您注意做好腹部保暖，饮食也要注意，多吃一些富含维生素的水果蔬菜，不要吃寒凉辛辣刺激性食物，多休息，避免劳累，一般过两天就会好的。