慢性肾盂肾炎经治疗尿常规正常但肾功系列不正常，可能与多种因素有关，如炎症未完全消除、肾实质损伤、合并其他肾病、药物副作用、个体差异等。 1. 炎症未完全消除：尽管尿常规正常，但肾盂内可能仍有隐匿的炎症，影响肾功能。 2. 肾实质损伤：长期炎症刺激可能导致肾实质受损，影响肾脏的正常功能。 3. 合并其他肾病：如肾小球肾炎等，也会出现肾功系列不正常。 4. 药物副作用：治疗肾盂肾炎的药物可能对肾脏产生一定副作用。 5. 个体差异：每个人的肾脏恢复能力不同，恢复速度也有差异。 总之，需要综合多种检查结果和临床表现来明确原因。建议进一步做肾脏超声、尿微量蛋白等检查，以确定具体情况。治疗上可能需要调整用药，必要时进行肾脏保护治疗。同时要注意休息，避免劳累和感染。

慢性肾盂肾炎是细菌感染肾脏引起的慢性炎症病变,主要侵犯肾间质和肾盂,肾盏组织.慢性肾盂炎可表现为以下两种形式：慢性活动性肾盂肾炎和慢性非活动性肾盂肾炎.慢性肾盂肾炎,容易反复发作,其原因为：1,易感因素的存在；2,长期使用抗生素后,细菌产生耐药性；治疗：首要是寻找并去除导致发病的诱因并尽力祛除,如解除尿路梗阻,纠正畸形,提高机体免疫力等.选用抗生素的药物选择上,要尽可能按药敏试验结果,结合临床疗效来选用敏感的抗菌药物,应选用2～3种抗生素或中西医结合治疗.