肾盂肾炎它是由各种致病微生物直接侵袭所引起的肾盂肾盏粘膜和肾小管、肾间质感染性炎症。在一些患者的肾疤痕组织中存在病菌抗原，表明在这种疾病的发病机理中，免疫性肾组织损害也可以是它的原因之一。细菌从身体内的病灶侵入血流，到达肾脏引起炎症，血行感染时，细菌首先到达肾皮质，并在该处形成多数小脓肿，然后沿肾小管向下行扩散到肾乳头和肾盂。

上行感染是最常见的肾盂肾炎的原因。当机体抵抗力下降、尿道粘膜有轻微损伤后，细菌易侵袭膀胱和肾脏造成感染。由于女性尿道远较男性短而宽，女婴尿道口常被粪便污染，故易致病。有部分病人在急性肾盂肾炎期尿培养发现致病菌，而在以后的慢性进程中，尿培养却再没有致病菌出现，而疾病仍逐渐进入慢性肾盂肾炎。外伤或邻近肾脏的器官发生感染时，细菌可直接侵入肾脉引起肾盂肾炎。这也是肾盂肾炎的病因

如果尿路梗阻、畸形及机体免疫功能低下等易感因素持续存在，抗菌治疗未能彻底控制急性肾盂肾炎期形成的肾盂黏膜下的炎症或小脓疡，可留下小瘢痕，引起肾内梗阻，致使疾病反复发作及迁延为慢性肾盂肾炎。对于疾病要保持好的心态，任何疾病能够对症治疗都是有利于疾病得到康复的。