射精后疼痛可能由多种原因引起，如性生活不当、精囊炎、附睾炎、前列腺炎、尿道炎等。 1.性生活不当：性生活过于频繁、动作过于剧烈或粗暴，可能导致生殖器官损伤，从而引起射精疼痛。 2.精囊炎：精囊发生炎症时，精囊壁会充血、水肿，射精时肌肉收缩会引起疼痛。 3.附睾炎：附睾受到感染或炎症刺激，射精时会出现疼痛。 4.前列腺炎：前列腺发生炎症，会影响射精过程，导致疼痛。 5.尿道炎：尿道炎症会使尿道黏膜充血、水肿，射精时刺激尿道引起疼痛。 总之，射精后疼痛的原因较为复杂，如果出现这种情况，应及时就医，进行相关检查，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。

射精疼痛主要是性交过频或生殖器官病变引起的。性兴奋时，精囊、前列腺、输精管、射精管等器官的平滑肌收缩，把精液先排入尿道，接着阴茎根部的尿道球海绵体肌收缩，把精液排出体外。如性交过频会使这些肌肉过于兴奋，引起疼痛；生殖器官的病变也会使这些肌肉的兴奋性增高，引起痉挛性收缩，从而产生疼痛感。由于这些平滑肌和尿道球海绵体肌都是受阴部神经支配的，而支配肛门外括约肌的肛门神经是阴部神经的一条分支，所以当这些肌肉痉挛性收缩引起疼痛时，肛门也会因神经兴奋的扩散而感到疼痛。