手术后最常见的并发症是代偿性出汗，手汗症术后少部分患者在躯干尤其是背部、大腿等部位的出汗可能会比原来增多，这种现象称为代偿性出汗，是一种常见的并发症，随着手术方法的改善以及手术技巧的提高，这种并发症的发生率以及严重程度已经大大降低。多数病人的代偿性出汗症状相当轻微，不致造成日常活动的明显不便，且绝大多数病人的代偿性多汗会随着时间的推移逐渐缓解或适应。术后代偿性多汗与交感神经切除的范围有关，正确的手术方法可降低术后代偿性多汗;此外本来全身出汗就特别多的病人，术后代偿性多汗也会比较明显，而且相对比较严重;代偿性多汗大多在术后3~6月后缓解;代偿性多汗机制未明。Guttman报导这种并发症可能与热调节机制有关。Shelley 以及Fl0rence推断胸腔镜交感神经切除术后的多汗是代偿性的，并且起到热调节功能。　　其他并发症有霍纳氏综合症、血气胸以及皮下气肿等，其中霍纳氏综合症是最可怕的并发症。由于星状神经节受到损害所致的霍纳氏综合症，表现为一侧瞳孔缩小、眼球下陷、患侧颜面无汗以及眼睑下垂等。这与医生对手术的熟练程度以及手术技巧有关;只要掌握手术要领， 术中操作小心，其实很容易避免。

手汗症手术后遗症三手汗的手术后可能会发生代偿性流汗，也就是原先由手排出的汗水改由其它部份排出。一般术后手掌几乎完全无汗，手臂、腋窝、头脸部出汗大幅减轻，腹背部，大腿出汗手术后可能会增加。至于足部，有40-80%出汗可能减轻。这种情形在炎夏较明显，一般而言并不会构成太大的困扰，仅有少数的病患对代偿性流汗难以忍受。手术时如果破坏的交感神经节数范围较小。