三岁男童指甲自然脱落又长出新指甲且表面凹凸不平，可能是营养不良、感染、外伤、免疫性疾病、系统性疾病等原因导致。 1.营养不良：儿童如果缺乏维生素 A、B 族维生素、钙、铁等营养素，可能影响指甲的正常生长，导致指甲脱落和凹凸不平。可通过饮食调整，多吃富含这些营养素的食物，如胡萝卜、牛奶、鸡蛋、菠菜等。 2.感染：如真菌感染，会破坏指甲结构，引起指甲脱落和异常。需使用抗真菌药物，如酮康唑乳膏、特比萘芬乳膏等治疗。 3.外伤：指甲受到挤压、碰撞等外伤，可能造成指甲脱落和后续生长不平整。一般无需特殊治疗，等待新指甲逐渐长出。 4.免疫性疾病：像银屑病、扁平苔藓等免疫性疾病，可能累及指甲，导致指甲病变。需要针对原发病进行治疗，可能会用到免疫调节剂。 5.系统性疾病：某些系统性疾病，如甲状腺功能异常，也可能影响指甲。需治疗原发疾病，改善指甲状况。 总之，当发现孩子指甲出现异常时，建议及时就医，明确原因，采取相应的治疗措施。同时，要注意孩子的饮食营养均衡，保护指甲免受外伤。

不排除饮食结构不佳或是感染因素存在导致的对于这种情况有必要到医院皮肤科就诊检查明确具体的情况.

甲癣、甲沟炎、甲营养不良都有可能，治疗方法不一样，建议到附近大医院就诊，先确诊再说。对于这种情况有必要到医院皮肤科就诊检查明确具体的情况.