复发性腹痛的症状根据其病因的不同而有所不同。由器质性疾病引起的腹痛通常不会自动消失，周期性地发作且通常由于一些活动或某些食物引起，腹痛部位较固定且一般不在脐周，但疼痛可放射到背部。尿路感染可能会引起腹部和盆腔疼痛，而不同于成人的腰背部疼痛。疼痛经常可使儿童从睡梦中醒来。根据潜在的器质性疾病，儿童可能会有以下症状：食欲不振、体重减轻、反复的或持续的发热、黄疸、大便形态和颜色改变、便秘或腹泻、便血、呕吐、呕血、腹部膨隆、关节疼痛或肿胀。由器官功能失调引起的复发性腹痛，其症状也因其潜在的病因而有所不同。例如，如果患儿的基础疾病为乳糖不耐受综合征，在喝了牛奶或吃了乳制品后几分钟或最多两小时就会腹痛。如果儿童有胆囊疾病，则在进食脂肪性食物后，就会立刻发生腹痛。由于心理原因引起的腹痛，每日或隔数日就会发作一次，极少出现几周或数月都不发作的情况;腹痛通常不太严重;患儿对疼痛的描述通常很模糊，但有时为绞痛。这种疼痛很少在夜里将儿童痛醒，但可使患儿比正常的情况下早一些醒来。心理原因引起的腹痛经常发生在脐周。离脐越远，疼痛就越有可能是由器质性疾病引起的。心理原因引起的腹痛有时类似于器质性疾病引起的疼痛，但疼痛通常不会改变也不会加重。疼痛特征有大的变化可能意味着儿童也有器质性疾病。