感染乙肝两年后出现小腹疼痛，可能与乙肝病情变化、腹部其他器官疾病、药物副作用、肠道问题、心理因素等有关。 1. 乙肝病情变化：乙肝如果进展为肝硬化或肝癌，可能影响腹部器官功能，导致疼痛。需要进一步检查肝功能、腹部超声等。 2. 腹部其他器官疾病：如膀胱炎、盆腔炎、输尿管结石等，这些疾病也会引起小腹疼痛，可通过尿液检查、超声等明确。 3. 药物副作用：长期服用治疗乙肝的药物可能有副作用，影响腹部器官。 4. 肠道问题：肠炎、肠痉挛等肠道疾病也会导致小腹疼痛，可能与饮食、感染等有关。 5. 心理因素：长期患病带来的心理压力，可能导致躯体化症状，表现为小腹疼痛。 总之，小腹疼痛的原因较为复杂。建议及时到正规医院就诊，进行全面检查，以确定具体原因，并采取相应的治疗措施。

急性肠梗阻，腹部脏器的结石，盆腔部脏器的急性血运障碍，如卵巢瘤蒂扭转，输卵管积水扭转，肠扭转等，以及寄生虫，痛经，盆腹部外伤均可引起急性下腹部疼痛。

乙肝患者出现小腹疼痛在临床中也是常见的，引起患者小腹疼痛的原因很多，对于小腹疼痛的患者，应注意保温和食用清淡食品，注意保持休息和充足睡眠，适当补充维生素和矿物质。