细菌性阴道炎经治疗后仍存在阴道小疙瘩，在怀孕三个月时，一般来说影响不大，但需综合多方面因素判断，如疙瘩性质、阴道炎恢复情况、个人体质、孕期卫生、胎儿发育等。 1. 疙瘩性质：小疙瘩可能是炎症刺激引起的增生组织，也可能是其他良性病变，如假性湿疣。若为恶性病变则较为严重。 2. 阴道炎恢复：若阴道炎未彻底治愈，可能增加孕期感染风险，但已治愈则影响较小。 3. 个人体质：个体的免疫力和抵抗力不同，体质好的孕妇可能更能抵御潜在风险。 4. 孕期卫生：孕期保持良好的个人卫生，如勤换内裤、清洗外阴，有助于减少感染。 5. 胎儿发育：通过定期产检，监测胎儿发育情况，能及时发现可能的异常。 总之，这种情况需要密切关注，定期产检，遵循医生建议，以确保孕妇和胎儿的健康。

建议使用醋来清洗阴道，也建议使用甲硝唑阴道泡腾片，为了避免宫内感染妊娠35周后禁止阴道操作。

怀孕后避免影响胎儿的因素。怀孕后按时孕期检查，如果你有阴道炎症需要复查看是否痊愈的，没痊愈需要继续治疗的，和医生说明你怀孕即可。