肾病综合症的危害性非常大，一般可导致急性肾功能衰竭。这是因为肾病综合征时肾间质水肿，蛋白浓缩形成管型堵塞肾小管等因素，可诱发急性肾功能衰竭。肾病综合症在发病过程中，由于大量免疫球蛋白自尿中丢失，血浆蛋白降低，影响抗体形成。肾上腺皮质激素及细胞毒药物的应用，使病人全身抵抗力下降，极易发生感染，如皮肤感染、原发性腹膜炎、呼吸道感染、泌尿系感染，甚至诱发败血症。

肾病综合症具有一定的危害性，其发病常有高脂血症及血液高凝状态，故易引发冠心病。有人报告肾病综合征病人的心肌梗塞发生率比正常人高8倍。冠心病已成为肾病综合征死亡原因的第三因素(仅次于感染和肾功能衰竭)。在肾病综合症的发病时期，容易发生血栓，尤其是膜性肾病发生率可达25％～40％。形成血栓的原因有水肿、病人活动少、静脉淤滞、高血脂、血液浓缩使粘滞度增加、纤维蛋白原含量过高及v、Ⅶ、Ⅷ、x因子增加和使用肾上腺皮质激素而血液易发生高凝状态等。这些都是肾病综合症的危害。

患者因大量高脂血症、蛋白尿、低蛋白血症，体内常处在低血容量及高凝状态;呕吐、腹泻、使用抗高血压药及利尿剂大量利尿时，都可使肾脏血灌注量骤然减少，进而使肾小球滤过率降低，导致急性肾功能衰竭。