结膜炎的治疗若是急性病毒性结膜炎可点用类固醇(可地松)眼药水以减轻病情.细菌性结膜炎则须投与抗生素药水药膏甚至口服或注射抗生素.治疗慢性结膜炎必须先找出原因.若是环境刺激原引起的则尽量减少接触刺激源如减少到公共场所(尤其是密闭室内)减少接触吸烟及燃烧废弃物之烟灰.若是过敏原引起的则避免接触花粉油漆灰尘.若长期使用眼药水或眼药膏所引起的可先停用眼药一段时间点用不含药物及防腐剂之眼药水(如生理食盐水或人工泪液)；而以毛巾热敷眼部(闭眼睛)一天三至四次每次五至十分钟也是简单易行而有效之方法.

结膜炎的治疗因病因不同而异.眼睑可用清水和干净毛巾轻轻洗净去除分泌物.如为细菌性结膜炎可滴用抗生素眼药水或药膏.医生有时会用棉签擦下一点分泌物送实验室检查再根据检查结果调整用药.一般结膜炎不需用皮质类固醇眼药水.如考虑是疱疹病毒性结膜炎则绝对不要滴用皮质类固醇眼药水其可能使病情加重.对于过敏性结膜炎和病毒性结膜炎抗生素治疗无效.如是过敏性结膜炎口服抗组胺药可以止痒和缓解刺激症状如果无效也可试用皮质类固醇眼药水.由于感染性结膜炎传染性很强患者在洗眼或滴药前后均应洗手.此外患者也不要触摸了患眼又去触摸另一眼用于清洁患眼的毛巾和浴巾应与其他毛巾分开.如病因是眼睑畸形或泪道阻塞则多需要手术治疗.

治疗结膜炎必须先找出原因.若是环境刺激原引起的则尽量减少接触刺激源如减少到公共场所(尤其是密闭室内)减少接触吸烟及燃烧废弃物之烟灰.若是过敏原引起的则避免接触花粉油漆灰尘.若长期使用眼药水或眼药膏所引起的可先停用眼药一段时间点用不含药物及防腐剂之眼药水(如生理食盐水或人工泪液)；而以毛巾热敷眼部(闭眼睛)一天三至四次每次五至十分钟也是简单易行而有效之方法.若是慢性眼睑炎引起的则治疗要花一段时间.将眼睑缘之分泌物清理干净；挤压睑板腺；以婴儿洗发精洗净睫毛毛根(每天三四次)；热敷并点消炎药膏等方法都有助益.

如果是病毒性的结膜炎可用0.1%的无环鸟苷0.1%的碘苷(疱疹净)或4%吗啉双胍等眼药水来治疗注意用眼卫生：尽量不用手或异物挑触眼睛少看电视电脑等.加强锻炼提高自身免疫力.

一般情况下应该进行局部的治疗效果是非常好的.分以下一种情况：一当患眼分泌物比较多试可用无刺激性的冲洗剂进行冲洗如3%的硼酸水或者是生理盐水冲洗结膜囊.冲洗是应该避免算上角膜上皮误使冲洗液流入健眼.2充分滴用有效的抗生素眼液和眼药膏.急性阶段应该每一个小时到两个小时点一次.1.格兰阳性菌所致者可使用5000-10000U/ml青霉素15%的磺胺醋酰钠0.1%利福平杆菌肽0.5%氯霉素等眼液频发滴眼.2.格兰阴性菌所致者应该用氨基糖苷类或者喹诺酮类药物如0.3%庆大霉素0.3%妥布霉素0.3%环丙沙星0.3%氧氟沙星眼药水或眼药膏.