1.与新生儿食管闭锁相鉴别新生儿食管闭锁日前多用Gross五型进行分类病发时婴儿也会口腔分泌物增多的症状喂水喂奶后会出现呛咳、紫绀和窒息时用硬软适中的导管经鼻或口腔插入食管若导管自动返回时可能为该病但明确诊断必须用碘油作食管造影;2.与新生儿膈疝相鉴别新生儿膈疝婴儿出生后即有呼吸困难及持续和阵发性紫绀同时还伴有顽固性呕吐体检时胸部左侧呼吸运动减弱叩诊左侧呈鼓音或浊音听诊呼吸音低远或消失有时可听到肠鸣音心浊音界及心尖搏动移向右侧呈舟状腹X线胸腹透视或照片即能诊断;3.与新生儿鼻后孔闭锁相鉴别临床表现：出生后即有严重的吸气困难、发绀张口或啼哭时则发绀减轻或消失闭口和吸奶时又有呼吸困难由于患者喂奶困难以致造成体重不增或严重营养不良

临床表现，出生后即有严重的吸气困难、发绀张口或啼哭时则发绀减轻或消失闭口和吸奶时又有呼吸困难，由于患者喂奶困难以致造成体重不增或严重营养不良。