1.解剖学因素：肛门外括约肌浅部，从尾骨起，向前至肛门后方。肛门前、后方不如两侧牢固，容易受损伤。因此，肛门后部受粪便压迫较重，又因肛管后部血液循环不足，弹性较差，肛门腺分布又较多，这些都是发生肛裂的因素。
2.外伤学说：干硬的粪便或异物容易引起肛管皮肤的损伤，这是引起肛裂的主要因素。
3.感染学说：主要是肛门后部的肛隐窝感染，炎症向肛管皮下部蔓延，致使皮下脓肿破溃而成肛裂。
4.内括约肌痉挛学说：由于肛管部位损伤或炎症刺激，使肛门括约肌处于痉挛状态，致使肛管张力增强，易损伤成肛裂。
5.肛门狭小学说：肛管皮肤在发育中迟缓，生成肛管狭小，易损伤成肛裂。

引起肛裂的原因主要有：
1.大便异常 肛裂首先是因为来自外力的冲击或摩擦。如果粪便过粗过硬，此时肛门适应性较差，会使肛管裂开，有人研究发现，不仅是便秘，腹泻也会产生肛裂，可占到肛裂诱因的4%～7%。
2.内括约肌痉挛 内括约肌张力高，可造成肛管静息压明显增高，如此时肛门的舒展性不够，当干硬的粪便通过时，会产生裂口。内括约肌受到粪便残渣和肠液刺激，发生痉挛，导致剧烈疼痛。肛门内括约肌张力升高的主要原因有：
（1）炎症刺激 肠道、肛管或肛窦发生炎症时，刺激内括约肌紧张。
（2）酸性粪便刺激 如同胃酸过多会刺激肠黏膜导致胃或十二指肠溃疡、胃痉挛疼痛。粪便一般呈碱性，当菌群失调时粪便成酸性，刺激肛门内括约肌发生痉挛。
（3）括约肌外露
（4）情绪异常 如气愤、紧张时。