猪球虫病是由艾美耳属和等孢属球虫引起的。猪球虫的生活史与其他动物的球虫一样，在宿主体内进行无性世代（裂殖生殖）和有性世代（配子生殖）两个世代繁殖，在外界环境中进行孢子生殖。卵囊随粪便排到外界，刚排出的卵囊内含有一个单细胞的合子。在适宜的氧气、湿度和温度条件下，卵囊经孢子化发育至感染阶段。当孢子化卵囊被猪吞入后，子孢子释出，进入肠腔，钻人肠上皮细胞，在上皮细胞内变成圆形滋养体。滋养体经裂殖生殖发育为裂殖体，裂殖体成熟后，每一个裂殖体含有许多裂殖子。当宿主细胞破坏崩解时，裂殖子从成熟的裂殖体释出，进入肠腔。当逸出的裂殖子侵入其他肠细胞，就可能发育形成新一代裂殖体或配子体。在进行了2～3代裂殖生殖之后便开始转入配子生殖；裂体生殖的代数依球虫的种类而定，但所有虫种最终都要形成配子体。有性阶段的虫体是大配子体和小配子体。大配子体积较大，通常在一个宿主细胞仅有一个大配子；而小配子体一般数量较少，但含有许多高度运动的、带鞭毛的小配子，这种小配子相当于高等动物的精子。最终含有小配子体的宿主细胞崩解，小配子逸出，进入肠腔，进而钻入含有大配子的肠细胞，使大配子受精。

过去，人们一般认为只有猪等孢球虫的致病力较强，而艾美球虫的致病力很弱。但近年来的流行病学调查和试验研究证明，猪的艾美球虫病相当普遍，即使是在亚临床状态，其造成的损失也不可低估。多数种类的猪艾美球虫，如光滑艾美球虫、粗糙艾美球虫、蒂氏艾美球虫、猪艾美球虫、有刺艾美球虫和新蒂氏艾美球虫，都可引起乳猪和断奶仔猪发生球虫病，表现出发热、腹泻、体重降低、食欲下降等临床症状。