一般治疗：去除病因，如治疗便秘，慢性咳嗽及前列腺肥大等，每日行提　肛锻炼数百次，增强括约肌功能，防止脱垂。并养成良好的大便习惯，缩短排便时间，脱垂后立即复位，防止水肿，嵌顿。硬化剂注射疗法：适用于病程较长的儿童及用胶布粘合法无效者，以及成人轻度直肠脱垂。用骶管麻醉或局麻，儿童可用全麻。常用的有骨盆直肠间隙注射法和黏膜注射法。前者目的是使直肠和周围组织黏连固定，后者是使黏膜与直肠肌层黏连固定。

手术疗法：适用于非手术治疗失败或成人完全性直肠脱垂。常用的手术有经腹的如Goldberg手术（即直肠缝合固定加乙状结肠部分切除吻合术）、Orr手术（直肠骶骨悬吊术）、Ivalon海绵植入术、Nigro手术（适用于盆地缺损较大，直肠角完全消失的完全性直肠脱垂）和直肠前壁折叠术。经会阴的如Altemeir手术（适用于年老体弱，不能耐受经腹手术的患者）和肛门环缩术（适用于年老、体弱不能耐受交大手术者，或作为辅助治疗。）近年来随着腹腔镜手术技术的发展，也开展了经腹腔镜手术治疗直肠脱垂，适用于直肠脱垂行悬吊术者。