对本病的治疗也应以手术加放疗为宜，依据病理结果来设计靶区。松果体母细胞瘤、畸胎瘤和生殖细胞瘤对化疗敏感，畸胎瘤对放疗不敏感，而化疗却可获得较好的疗效。

一般主张先手术切除肿瘤目的为明确肿瘤性质减小肿瘤体积为放疗创造条件生殖细胞瘤是颅内肿瘤中对放疗最敏感的肿瘤对高度怀疑生殖细胞瘤但不具备手术切除条件的患儿可在做脑室腹腔分流术后行放射治疗传统的放疗方案是全神经轴放射治疗包括：肿瘤灶50～55Gy全脑和脊髓30～36Gy以防止播散转移此方案效果良好能将患儿10年期生存率提高到85%～100%目前研究多是用联合化疗来减少放疗的范围和剂量以防止放疗造成的儿童生长发育停滞的副反应现已取得普遍认同的方法是：首先根据肿瘤CTMRI影像学特点结合血液脑脊液中肿瘤标记物(AFPβ-HCG)含量测定及脑脊液中肿瘤细胞学检查结果对肿瘤性质做初步判定必要时可做立体定向活检常用的化疗药物(如卡铂长春新碱环磷酰胺等)可用作试验性化疗在化疗过程中对影像学及肿瘤标记物复查以评价肿瘤对化疗的敏感性如果化疗反应敏感则在化疗疗程结束后做减量放疗有人只减少放疗剂量(瘤灶30Gy;脊髓轴21Gy)而不减少照射范围近来有人在化疗后对肿瘤做局部小范围低剂量(24Gy)的放射治疗也取得良好效果而对于松果体区生殖细胞瘤以外的生殖细胞肿瘤除成熟畸胎瘤预后较好外(手术切除后10年期PFS为92.9%)其他类型均表现显著侵蚀性虽然对放化疗也有一定效果但3年期整体生存率仅为27.3%