咽喉及食管有病变时可出现吞咽困难。咽部急性炎症时，可因吞咽疼痛而妨碍进食，如扁桃体周围炎、急性会厌炎等。小儿咽后脓肿时，可妨碍吞咽并多伴有呼吸困难。咽、食管有异物时，因疼痛或异物嵌顿可出现吞咽困难。肿瘤所致的吞咽困难多呈进行性加重，应特别引起重视。此外，食管化学性灼伤也是引起吞咽困难的原因之一。与吞咽有关的神经、肌肉功能障碍时均可出现吞咽困难，应进行神经系统检查，以便针对病因进行治疗。